Префеновая кислота: различия между версиями

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
[отпатрулированная версия][отпатрулированная версия]
Содержимое удалено Содержимое добавлено
дополнение, источники
литература на русском языке
Строка 97: Строка 97:


==== Механизм кислотной ароматизации ====
==== Механизм кислотной ароматизации ====
При кислотной ароматизации упомянутое дегидратационное декарбоксилирование (сопряжённое элиминирование) протекает двуступенчато (протонирование гидроксильной группы вызывает её элиминирование — происходит обратимая дегидратация с образованием [[Теория резонанса|резонансно]]-стабилизированного [[карбкатион]]а, затем происходит декарбоксилирование, сопровождаемое нейтрализацией зарядов и формированием конечного продукта — фенилпирувата),{{.ref|<ref name="MechanismPDHandAcid" />}} в отличие от [[Ферменты|ферментативной]] (префенатдегидратазной) реакции, которая происходит согласованно ([[Уходящая группа|уходящие группы]] отщепляются синхронно, в одну стадию).{{.ref|<ref name="MechanismPrephenateDehydratase">{{статья|автор=Jeremy Van Vleet, Andreas Kleeb, Peter Kast, Donald Hilvert, W.W. Cleland|заглавие=<sup>13</sup>C isotope effect on the reaction catalyzed by prephenate dehydratase|ссылка= |язык=en|издание=Biochimica et Biophysica Acta|тип=Научный журнал|год=2010|том=1804|номер=4|страницы=752—754|doi=10.1016/j.bbapap.2009.11.018|issn= |pmid=19948253}}</ref>}}
Упомянутое дегидратационное декарбоксилирование (сопряжённое элиминирование), катализируемое кислотой, протекает двуступенчато (протонирование гидроксильной группы вызывает её элиминирование — происходит обратимая дегидратация с образованием [[Теория резонанса|резонансно]]-стабилизированного [[карбкатион]]а, затем происходит декарбоксилирование, сопровождаемое нейтрализацией зарядов и формированием конечного продукта — фенилпирувата),{{.ref|<ref name="MechanismPDHandAcid" />}} в отличие от [[Ферменты|ферментативной]] (префенатдегидратазной) реакции, которая происходит согласованно ([[Уходящая группа|уходящие группы]] отщепляются синхронно, в одну стадию).{{.ref|<ref name="MechanismPrephenateDehydratase">{{статья|автор=Jeremy Van Vleet, Andreas Kleeb, Peter Kast, Donald Hilvert, W.W. Cleland|заглавие=<sup>13</sup>C isotope effect on the reaction catalyzed by prephenate dehydratase|ссылка= |язык=en|издание=Biochimica et Biophysica Acta|тип=Научный журнал|год=2010|том=1804|номер=4|страницы=752—754|doi=10.1016/j.bbapap.2009.11.018|issn= |pmid=19948253}}</ref>}}


==== Механизм щелочной ароматизации ====
==== Механизм щелочной ароматизации ====
Строка 147: Строка 147:


== Литература ==
== Литература ==
# {{книга|автор=Бартон Д., Оллис У. Д., Хаслам Э. (ред.)|часть= |ссылка часть= |заглавие=Общая органическая химия|оригинал=Comprehensive organic chemistry|ссылка= |викитека= |ответственный=Перевод с английского под ред. Н. К. Кочеткова|издание= |место=М.|издательство=«Химия»|год=1986|том=11 (Липиды, углеводы, макромолекулы, биосинтез)|страницы=685—724|страниц=736|серия= |isbn= |тираж=}}
* Мецлер Д. — «Биохимия. Химические реакции в живой клетке» (том 3). Перевод на русский язык под ред. Академика А. Е. Браунштейна; Москва, «Мир», 1980 г.
# {{книга|автор=Мецлер Д.|часть= |ссылка часть= |заглавие=Биохимия. Химические реакции в живой клетке|оригинал=Biochemistry. The chemical reactions of living cells|ссылка= |викитека= |ответственный=Перевод с английского под ред. акад. А. Е. Браунштейна, д-ра хим. наук Л. М. Гинодмана, д-ра хим. наук Е. С. Северина|издание= |место=М.|издательство=«Мир»|год=1980|том=3|страницы= |страниц=488|серия= |isbn= |тираж=25000|ref=Мецлер, том 3}}


[[Категория:Двухосновные карбоновые кислоты]]
[[Категория:Двухосновные карбоновые кислоты]]

Версия от 23:52, 5 июля 2015

Префеновая кислота
Изображение химической структуры
Общие
Систематическое
наименование
Цис-​1-​​(2-​карбокси-​2-​оксоэтил)​-​4-​гидроксициклогекса-​2,5-​диен-​1-​карбоновая кислота
Хим. формула C10H10O6
Физические свойства
Молярная масса 226,18 г/моль
Классификация
Рег. номер CAS 126-49-8
PubChem
SMILES
InChI
ChEBI 16666 и 84387
ChemSpider
Приведены данные для стандартных условий (25 °C, 100 кПа), если не указано иное.
Логотип Викисклада Медиафайлы на Викискладе

Префе́новая кислота, по анионной форме называемая также префена́т — органическая двухосновная кислота, образуется в ходе шикиматного пути из хоризмата, является ключевым промежуточным метаболитом на пути к фенилаланину, тирозину, фенилпропаноидам и другим соединениям. Шестичленный карбоцикл префената легко подвержен ароматизации в одну стадию. Фенильная группа фенилпирувата, фенилаланина происходит из префената, отсюда и название этого соединения. Название предложил Бернард Дэвис.

Стереохимия и изомеры

Молекула (в наиболее симметричных конформациях) имеет плоскость симметрии (которая проходит через 6 из 10 атомов углерода), то есть, симметрична при операции отражения (ахиральна), но, тем не менее, по причине различия заместителей при двух тетраэдрических атомах углерода цикла возможно 2 диастереомера (цис-изомер и транс-изомер). Природная префеновая кислота является цис-изомером (старшие группы — четвертичный карбоксил в положении 1 и гидроксильная группа в положении 4 — ориентированы по одну сторону от «плоскости» цикла). Эпимер (транс-изомер), названный эпипрефеновой кислотой, был синтезирован,Шаблон:.ref Шаблон:.ref как оказалось, некоторые его химические свойства существенно отличаются.Шаблон:.ref Префеновая, эпипрефеновая, изопрефеновая, хоризмовая, 4-эпихоризмовая, изохоризмовая и псевдохоризмовая кислоты изомерны.

Физические свойства

Молекула ахиральна, поэтому префеновая кислота оптической активностью не обладает.Шаблон:.ref Шаблон:.ref В свободном виде не получена, выделяют в форме солей. Соли префеновой кислоты (префенаты) — кристаллические вещества. Соли бария малорастворимы в воде, что используется для осаждения префената из раствора с целью его выделения.Шаблон:.ref

Спектральные свойства

1H-ЯМР (D2O, 250 MГц), δ (ppm): 3,12 (2H, s), 4,50 (1H, tt, J1 = 3,1, J2 = 1,4 Гц), 5,92 (2H, dd J1 = 10,4, J2 = 3,1 Гц), 6,01 (2H, d, J1= 10,4, J2 = 1,4 Гц).Шаблон:.ref Протоны —OH и —CH2—CO— групп префената (натрия) быстро обмениваются с D2O.Шаблон:.ref

13C-ЯМР (D2O, 75 MГц), δ (ppm): 203, 178, 173, 132 (для двух идентичных атомов углерода), 127 (для двух идентичных атомов углерода), 65, 49, 48.

  • δ — химический сдвиг, H — интеграл (общее число протонов), d — дублет, dd — дублет дублетов, J — константа расщепления, t — триплет, s — синглет.

Химические свойства

Префеновая «кислота» стабильна только в дианионной форме.Шаблон:.ref Склонна к спонтанной и каталитической ароматизации.Шаблон:.ref Период полусуществования (полураспада) в водном растворе при комнатной температуре — 130 ч при рН = 7,0, 13 ч при рН = 6,0, и 1,0 мин в 1 Н HCl.Шаблон:.ref

Кислото- и щёлочелабильность

В кислой среде (даже в слабокислой при pH = 6) Шаблон:.ref при комнатной температуре префеновая кислота почти количественно ароматизуется в фенилпировиноградную кислоту (фенилпируват) в результате реакции дегидратационного декарбоксилирования (по механизму — сопряжённое элиминирование),Шаблон:.ref Шаблон:.ref при нагревании в щелочной среде — в пара-гидроксифенилмолочную кислоту (пара-гидроксифениллактат, обратите внимание на структурную близость этого соединения пара-гидроксифенилпирувату) в результате реакции декарбоксилирования.Шаблон:.ref Шаблон:.ref

Эпимер префеновой кислоты (эпипрефеновая кислота) имеет несколько отличные химические свойства: в щелочной среде он практически не ароматизуется, а в кислой, аналогично префеновой кислоте, легко переходит в фенилпировиноградную кислоту с почти количественным выходом.Шаблон:.ref Скорость кислотной ароматизации эпипрефеновой кислоты существенно ниже, чем скорость ароматизации префеновой кислоты в тех же условиях (а также ниже, чем скорости ароматизации полученных синтетически дезоксопрефеновой и эпидезоксопрефеновой кислот), что связывают с возможностью вовлечения гидроксильной группы эпипрефеновой кислоты в образование внутримолекулярного полукеталя (в случае префеновой кислоты образование внутримолекулярного полукеталя затруднено).Шаблон:.ref

Только после обнаружения префената, установления его структуры и основны́х свойств, стало известно, что циклогексадиенолы подобного типа кислотолабильны и чрезвычайно склонны к ароматизации.Шаблон:.ref Шаблон:.ref

Механизм кислотной ароматизации

Упомянутое дегидратационное декарбоксилирование (сопряжённое элиминирование), катализируемое кислотой, протекает двуступенчато (протонирование гидроксильной группы вызывает её элиминирование — происходит обратимая дегидратация с образованием резонансно-стабилизированного карбкатиона, затем происходит декарбоксилирование, сопровождаемое нейтрализацией зарядов и формированием конечного продукта — фенилпирувата),Шаблон:.ref в отличие от ферментативной (префенатдегидратазной) реакции, которая происходит согласованно (уходящие группы отщепляются синхронно, в одну стадию).Шаблон:.ref

Механизм щелочной ароматизации

Для щелочной ароматизации предложено не менее 5 альтернативных механизмов.Шаблон:.ref

Другие химические свойства

Префеновая кислота гидрируется водородом в присутствии платинового катализатора (присоединяет 3—4 молярных эквивалента водорода). Борогидрид натрия (NaBH4) восстанавливает префеновую кислоту по карбонилу, продукт восстановления способен декарбоксилироваться, ароматизуясь при этом, или присоединять 2 молярных эквивалента Br2.Шаблон:.ref Гидрирование над палладий-барий сульфатом приводит к восстановлению обеих двойных связей в цикле.Шаблон:.ref

Биохимия

Синтезируется из хоризмата в результате [3,3]-сигматропной перегруппировки, преимущественно ферментативной. Предшественник фенилаланина, тирозина и множества других соединений (в основном ароматических, бо́льшую часть из которых выделяют в большу́ю группу так называемых фенилпропаноидов).Шаблон:.ref

Схема перегруппировки хоризмата в префенат и последующей ароматизации префената в фенилпируват. Обе реакции легко протекают неферменитативно при нагревании или подкислении среды, в природе катализируются ферментами
Схема перегруппировки хоризмата в префенат и последующей ароматизации префената в фенилпируват. Обе реакции легко протекают неферменитативно при нагревании или подкислении среды, в природе катализируются ферментами
Префенат

Для префената, кроме указанной функции предшественника важнейших ароматических соединений, была обнаружена дополнительная функция донора карбоксильной группы в одной из описанных карбокситрансферазных реакций грамотрицательных бактерий. В этой реакции карбоксильная группа переносится с префената на метильную группу S-аденозил-l-метионина (SAM), что приводит к образованию карбокси-S-аденозил-l-метионина (Cx-SAM), сам же префенат при этом ароматизуется в фенилпируват. У грамотрицательных бактерий Cx-SAM участвует в консервативных посттранскрипционных модификациях тРНК. Cx-SAM является донором карбоксиметильной группы при модификации уридина в 5-оксиацетилуридин (cmo5U), который присутствует в колебательной позиции антикодоновой петли определённых тРНК.Шаблон:.ref

Другие известные природные циклогексадиенолы

В природе открыты и другие циклогексадиенолы, аналогичные префенату. Их синтез происходит шикиматным путём (некоторые образуются модификацией самого́ префената), все они легко ароматизуются и выступают предшественниками в биосинтезе различных метаболитов (в основном ароматических, в меньшей мере алициклических). Кроме префената известны следующие природные циклогексадиенолы, а также им подобные циклогексадиенамины:

  • арогеновая кислота (арогенат, претирозин) — образуется в результате переаминирования префената, непосредственный предшественник фенилаланина и тирозина у многих организмов.Шаблон:.ref
  • спиро-арогеновая кислота (спиро-арогенат, лактамное производное арогената) — найдена в культуре мутантного штамма Neurospora crassa.Шаблон:.ref
  • d-префенилмолочная кислота (d-префениллактат, восстановленное по карбонилу производное префената) — найдена в культуре мутантного штамма Neurospora crassa. Кислотолабильность выше, чем у префената. Продукт кислотной ароматизации — d-фенилмолочная кислота (d-фениллактат).Шаблон:.ref
  • 4-амино-4-дезоксипрефеновая кислота (4-амино-4-дезоксипрефенат) — образуется в результате [3,3]-сигматропной перегруппировки 4-амино-4-дезоксихоризмата, предшественник непротеиногенной аминокислоты пара-аминофенилаланин (метаболические производные этого соединения — некоторые известных антибиотики, в том числе хлорамфеникол).Шаблон:.ref
  • изопрефеновая кислота (изопрефенат) — образуется в результате [3,3]-сигматропной перегруппировки изохоризмата, предшественник некоторых вторичных метаболитов растений и микроорганизмов (непротеиногенные ароматические аминокислоты определённого типа и другие соединения).Шаблон:.ref
Природные циклогексадиенолы, а также им подобные циклогексадиенамины — малостабильные легко ароматизующиеся соединения шикиматного происхождения — предшественники первичных и значимых вторичных метаболитов
Природные циклогексадиенолы, а также им подобные циклогексадиенамины — малостабильные легко ароматизующиеся соединения шикиматного происхождения — предшественники первичных и значимых вторичных метаболитов
Префеновая
кислота
l-Арогеновая
кислота
Спиро-арогеновая
кислота
d-Префенилмолочная
кислота
4-амино-
4-дезоксипрефеновая
кислота
Изопрефеновая
кислота

Открытие, изучение и синтез

Префеновая кислота была впервые описана в 1954 году при изучении стадии ароматизации процесса биосинтеза фенилаланина. Исследователи, открывшие префенат, опираясь на его химические свойства, ИК спектры и УФ спектры поглощения, верно вывели структуру соединения, но без учёта стереохимии.Шаблон:.ref Дальнейший прогресс в изучении шикиматного пути, открытие Шаблон:.ref и описание структуры Шаблон:.ref непосредственного предшественника префената — хоризмата — позволили приписать префеновой кислоте стереохимическую конфигурацию, но всё же эта конфигурация в течение ещё довольно долгого времени не была надёжно подтверждена корректными методами. В 1977,Шаблон:.ref а затем в 1979 Шаблон:.ref годах Сэмюэль Данишефский[англ.] и сотрудники сообщили о проведённом ими первом успешном полном синтезе префената натрия и об окончательном подтверждении конфигурации префеновой кислоты. В основе синтеза Данишефского лежит реакция Дильса — Альдера. Полученное вещество по спектральным свойствам было идентичным коммерческим образцам (Sigma Chemicals) префената биогенного происхождения, что являлось подтверждением успешного синтеза.Шаблон:.ref

Схема полного синтеза префената натрия и эпипрефената натрия по Данишефскому
Схема полного синтеза префената натрия и эпипрефената натрия по Данишефскому

Хотя предложенный метод химического синтеза префеновой кислоты не способен конкурировать с её биотехнологическим производством, он может быть полезен для синтеза структурных аналогов и производных префеновой кислоты,Шаблон:.ref а также для получения изотопно-меченого префената.Шаблон:.ref К настоящему времени получены с целью изучения различные структурные аналоги префеновой кислоты, например, бензологи (структурные производные 9,10-дигидроантрацена).Шаблон:.ref

Производство и форма выпуска

В диацидной форме нестабильна,Шаблон:.ref в кристаллическом виде получают в форме солей. Выпускается в форме бариевой соли (префенат бария).Шаблон:.ref Производят при помощи специальных штаммов Neurospora crassa, Escherichia coli, Bacillus subtilis, Salmonella typhimurium; возможно как прямое выделение из культуральных фильтратов, так и получение метаболического предшественника (хоризмата) с последующей его химической или ферментативной изомеризацией.Шаблон:.ref

Применение

Находит применение в исследовательской практике.

Примечания

Литература

  1. Бартон Д., Оллис У. Д., Хаслам Э. (ред.). Общая органическая химия = Comprehensive organic chemistry / Перевод с английского под ред. Н. К. Кочеткова. — М.: «Химия», 1986. — Т. 11 (Липиды, углеводы, макромолекулы, биосинтез). — С. 685—724. — 736 с.
  2. Мецлер Д. Биохимия. Химические реакции в живой клетке = Biochemistry. The chemical reactions of living cells / Перевод с английского под ред. акад. А. Е. Браунштейна, д-ра хим. наук Л. М. Гинодмана, д-ра хим. наук Е. С. Северина. — М.: «Мир», 1980. — Т. 3. — 488 с. — 25 000 экз.