HERC4

HERC4
Ідентифікатори
Символи	HERC4, HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4
Зовнішні ІД	OMIM: 609248 MGI: 1914595 HomoloGene: 56715 GeneCards: HERC4
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity Клітинна компонента • fibrillar center • гіалоплазма • цитоплазма Біологічний процес • Убіквітин-залежний протеоліз • Сперматогенез • диференціація клітин Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	26091	67345
Ensembl	ENSG00000148634	ENSMUSG00000020064
UniProt	Q5GLZ8	Q6PAV2
RefSeq (мРНК)	NM_001017972 NM_001278185 NM_001278186 NM_001278187 NM_015601 NM_022079	NM_026101 NM_030114 NM_001359484
RefSeq (білок)	NP_001265114 NP_001265115 NP_001265116 NP_056416 NP_071362	NP_080377 NP_084390 NP_001346413
Локус (UCSC)	Хр. 10: 67.92 – 68.08 Mb	Хр. 10: 63.08 – 63.15 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HERC4 (англ. HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 10-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 057 амінокислот, а молекулярна маса — 118 563.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLCWGNASFG		QLGLGGIDEE		IVLEPRKSDF		FINKRVRDVG		CGLRHTVFVL
DDGTVYTCGC		NDLGQLGHEK		SRKKPEQVVA		LDAQNIVAVS		CGEAHTLALN
DKGQVYAWGL		DSDGQLGLVG		SEECIRVPRN		IKSLSDIQIV		QVACGYYHSL
ALSKASEVFC		WGQNKYGQLG		LGTDCKKQTS		PQLLKSLLGI		PFMQVAAGGA
HSFVLTLSGA		IFGWGRNKFG		QLGLNDENDR		YVPNLLKSLR		SQKIVYICCG
EDHTAALTKE		GGVFTFGAGG		YGQLGHNSTS		HEINPRKVFE		LMGSIVTEIA
CGRQHTSAFV		PSSGRIYSFG		LGGNGQLGTG		STSNRKSPFT		VKGNWYPYNG
QCLPDIDSEE		YFCVKRIFSG		GDQSFSHYSS		PQNCGPPDDF		RCPNPTKQIW
TVNEALIQKW		LSYPSGRFPV		EIANEIDGTF		SSSGCLNGSF		LAVSNDDHYR
TGTRFSGVDM		NAARLLFHKL		IQPDHPQISQ		QVAASLEKNL		IPKLTSSLPD
VEALRFYLTL		PECPLMSDSN		NFTTIAIPFG		TALVNLEKAP		LKVLENWWSV
LEPPLFLKIV		ELFKEVVVHL		LKLYKIGIPP		SERRIFNSFL		HTALKVLEIL
HRVNEKMGQI		IQYDKFYIHE		VQELIDIRND		YINWVQQQAY		GMDVNHGLTE
LADIPVTICT		YPFVFDAQAK		TTLLQTDAVL		QMQMAIDQAH		RQNVSSLFLP
VIESVNPCLI		LVVRRENIVG		DAMEVLRKTK		NIDYKKPLKV		IFVGEDAVDA
GGVRKEFFLL		IMRELLDPKY		GMFRYYEDSR		LIWFSDKTFE		DSDLFHLIGV
ICGLAIYNCT		IVDLHFPLAL		YKKLLKKKPS		LDDLKELMPD		VGRSMQQLLD
YPEDDIEETF		CLNFTITVEN		FGATEVKELV		LNGADTAVNK		QNRQEFVDAY
VDYIFNKSVA		SLFDAFHAGF		HKVCGGKVLL		LFQPNELQAM		VIGNTNYDWK
ELEKNTEYKG		EYWAEHPTIK		IFWEVFHELP		LEKKKQFLLF		LTGSDRIPIL
GMKSLKLVIQ		STGGGEEYLP		VSHTCFNLLD		LPKYTEKETL		RSKLIQAIDH
NEGFSLI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до трансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, диференціація клітин, сперматогенез, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• Nagase T., Kikuno R., Nakayama M., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVIII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 273—281. PMID 10997877 DOI:10.1093/dnares/7.4.271
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 10